Byl také výborným chirurgem, který významně přispěl k rozvoji tohoto oboru, a to nejen u nás. Měl vynikající vztahy s Českou Filharmonií a dlouhou dobu orchestr doprovázel po světě jako jejich lékař. Spolupracoval také s velikány, jakým byl například Václav Neumann. Dr. Honěk zesnul ve věku nedožitých 91 let, 31. června 2002.
Jak sám rád říkal, jeho největším životním úspěchem nebyly samotné nástroje, ale to, že pro jejich kouzlo zapálil i svého syna a vnuky. Svěřil jim svá tajemství a naučil je, jak konstruovat mistrovské nástroje.
Dnes v tradici pokračuje nejen syn Tomáš Honěk (nar. 1950 v Praze) ale i tři vnuci Tomáš mladší, Jakub a Albert Vincenc. Výrobu houslí si už zamiloval i nejmladší pravnuk Tomáš (nar. 2010).